Команда ученых из Сингапура обнаружила новые способы, с помощью которых рак может ускользнуть от иммунной системы организма. Сосредоточившись на раке желудка (РЖ), третьей ведущей причине смерти от рака во всем мире, выводы команды могут оказаться применимыми и к другим основным видам рака с потенциальными последствиями для того, как лучше лечить рак с помощью иммунотерапии, одного из наиболее многообещающих классов противоопухолевых препаратов. лекарства от рака сегодня.
Промоторы – это участки в геноме, которые регулируют экспрессию генов, подобно переключателю лампочки. Используя сверхчувствительную технику под названием NanoChIP-seq, команда исследовала промоторный ландшафт для GC, чтобы лучше понять эпигенетические механизмы, способствующие развитию GC. Команда обнаружила, что в GC промоторы генов не регулируются таким образом, что изменяет антигенный профиль опухоли, чтобы ускользнуть от иммунной системы организма. В исследовании, опубликованном в ведущем журнале Cancer Discovery, участвовали ученые и клиницисты из Медицинской школы Duke-NUS, Института генома Сингапура, Института онкологии Сингапура (CSI Singapore) при Национальном университете Сингапура (NUS) и Национального онкологического центра. Сингапур (NCCS).
"Используя платформу NanoChIP-seq, изобретенную в Сингапуре, мы создали комплексные эпигенетические профили как для GC, так и для нормальных тканей," объяснил руководитель группы профессор Патрик Тан. "Эпигенетика – это процесс, при котором ДНК клетки химически модифицируется окружающей средой для изменения экспрессии генов. Сравнивая эпигенетические профили опухолей желудка с нормальными тканями у того же пациента, мы смогли идентифицировать те промоторы, которые специфически изменены в тканях GC." Профессор Тан является преподавателем Медицинской школы Duke-NUS, заместителем исполнительного директора Совета по биомедицинским исследованиям Агентства по науке, технологиям и исследованиям (A * STAR), а также старшим главным исследователем в CSI Singapore и главным исследователем в NCCS.
Так же, как светом можно управлять с помощью нескольких переключателей, чтобы влиять на его интенсивность и цвет, команда определила сотни генов, контролируемых несколькими промоторами, что привело к созданию альтернативных версий этого гена. Команда продемонстрировала, что некоторые из этих вариантов генов способны стимулировать рост рака. Поразительно, но команда также обнаружила, что многие из этих альтернативных вариантов генов, продуцируемых в опухолях желудка, также с меньшей вероятностью стимулировали иммунную систему по сравнению с их нормальными аналогами.
"Наши данные, объединяющие вычислительные, экспериментальные анализы и анализы рака желудка человека, показывают, что использование этих менее иммуногенных вариантов может повысить способность опухоли обходить иммунную систему хозяина. Этот процесс называется иммуноредактированием опухоли," добавила г-жа Адити Камра, аспирантка Института генома Сингапура и первый автор этого исследования. Она также является аспирантом отделения физиологии медицинской школы NUS Yong Loo Lin.
Полученные данные дают важную информацию о механизмах, используемых в развитии рака, и могут иметь значение для иммунотерапии рака. Хотя у некоторых пациентов, получавших иммунотерапию, наблюдались поразительные клинические реакции, эти препараты дороги, связаны с побочными эффектами, и не все пациенты реагируют на лечение. Результаты команды предполагают, что изучение профилей промоторов опухолей может, возможно, выявить тех пациентов, которые будут реагировать на иммунотерапию. Более того, команда также определила клеточные пути, необходимые опухолевой клетке для поддержания экспрессии менее иммуногенных вариантов генов. В настоящее время команда изучает, может ли нацеливание на эти пути в сочетании с иммунотерапией увеличить долю пациентов, которые могут реагировать на такие препараты.