Transcriptomics определяет гены, сигнальные пути, которые могут отрегулировать нейродегенерацию

Это исследование, сообщил в выпуске в феврале 2015 Экспериментальной Биологии и Медицины, использовал культурные мозжечковые нейроны гранулы, одну из наиболее широко используемых моделей, чтобы изучить нейронную смерть. Другие лаборатории использовали анализ микромножества ДНК, чтобы характеризовать изменения экспрессии гена в этой модели. Однако анализ микромножества только способен к измерению статуса известных расшифровок стенограммы, и выражение низкого изобилия mRNAs часто не обнаруживается основанным на гибридизации подходом.В то время как изменения в выражении нескольких сотен генов были обнаружены исследованиями микромножества в исследовании Д’Мелло и коллег более чем 4 000 генов показанное значительно измененное выражение.

Большинство затронутое было генами, функционирующими в некрозе клеток и регулировании выживания, росте клеток и быстром увеличении и молекулярном транспорте. Большое количество генов, вовлеченных в развитие нервной системы и функцию, было также разрегулировано. Анализ сигнальных путей, которые были затронуты, указал на изменения в митохондриальной функции и окислительном фосфорилировании, согласовывающемся со многими исследованиями, показывающими волнения этих путей в нейродегенеративных беспорядках. Было определено большое количество генов, ранее не связанных с развития отрегулированной нейронной смертью или нейродегенеративными патологиями. «Это – первый шаг в идентификации новых но важных игроков, регулирующих нейронное выживание и смерть,» сказал доктор Д’Мелло. «Будущие исследования определят, до какой степени новые гены, определенные в нашем исследовании, вовлечены в регулирование нейронной смерти, включая смерть, связанную с нейродегенеративным заболеванием».

Доктор Стивен Р. Гудмен, Главный редактор Экспериментальной Биологии и Медицины сказал «Д’Мелло, и коллеги выполнили исследование transcriptomic, использовав РНК-Seq, чтобы определить расшифровки стенограммы, которые изменены в выражении в умирающих нейронах. Используя эту очень чувствительную технику они смогли продемонстрировать существенные изменения в выражении более чем 4 000 генов.

Это исследование открывает дверь в будущие исследования, на которых из этих многих генов функционально вовлечены в нормальную нейронную смерть и связанный с различными нейродегенеративными беспорядками.