Генетическое разнообразие ферментов изменяет индивидуальность метаболизма

Ученые из Медицинской организации мегабанка Тохоку (ToMMo) Университета Тохоку опубликовали в научных отчетах исследования о генетическом разнообразии и метаболоме.

"Мы обнаружили генетические варианты, влияющие на ферментативную активность у здоровых людей," сказал доктор. Сэйдзо Кошиба. "Наше исследование показывает, что генетический полиморфизм, структурная локализация мутации и влияние на фенотип коррелируют друг с другом в человеческой популяции. Это означает, что метаболическая индивидуальность и предрасположенность к заболеваниям, возможно, являются результатом умеренных вариантов и гораздо более вредных, но редких вариантов."

В своем анализе исследователи обнаружили следующие результаты:

  • Взаимосвязь между структурными вариантами ферментов и метаболическими фенотипами в человеческой популяции была изучена при исследовании ассоциации концентраций метаболитов с данными анализа последовательности всего генома.
  • Выявлено пять ассоциаций между метаболитами и вариантами генов. Известно, что четыре варианта гена связаны с метаболическими заболеваниями. Остатки, замещенные этими вариантами, расположены в периферических областях каталитических сайтов или связанных регуляторных доменов ферментов.
  • У двух человек наблюдаются более значительные изменения уровня метаболитов фенилаланина. У них были редкие варианты генов, замещающие остатки, расположенные рядом с каталитическим сайтом.
  • Эти данные демонстрируют, что частота вариантов, структурное расположение и влияние на фенотип коррелируют друг с другом в человеческой популяции.
  • ToMMo будет изучать влияние окружающей среды и генетики на индивидуальные различия протеомики и метаболомики. ToMMo стремится обнаружить полезные биомаркеры для профилактики заболеваний и ранней диагностики посредством идентификации и количественного определения метаболитов в крови. Такие исследования могут способствовать продвижению персонализированной профилактики и лечения заболеваний, а также выявлению механизмов заболевания и разработке новых методов лечения.

    Эти результаты основаны на анализе образцов крови 512 здоровых людей, которые участвовали в когортном исследовании проекта Tohoku Medical Megabank на базе сообщества и когортном исследовании рождения и трех поколений.

    Некоторые данные можно найти на сайте ToMMo:

    Справочная панель по японской мульти-омике (jMorp) по адресу https: // jmorp.мегабанк.Тохоку.ac.jp /.