Новое исследование показывает, что шизофрения вызвана, по крайней мере частично, крупными и редкими структурными изменениями в ДНК, называемыми вариантами числа копий (CNV), а не крошечными однобуквенными изменениями (однонуклеотидными полиморфизмами (SNP), которые исследовали ученые). годами. Результаты опубликованы 6 февраля в журнале открытого доступа PLoS Genetics.
Шизофрения – одно из самых распространенных психических расстройств, но ученым еще предстоит определить значимые генетические связи. За последние два десятилетия десятки генов и SNP были идентифицированы как возможные кандидаты, но текущее исследование отклоняет их.
"Литература изобилует десятками генов и SNP, идентифицированных как связанные с шизофренией," – говорит первый автор Анна Нид, доктор философии, научный сотрудник Центра вариации генома человека при Институте генома и науки Дьюка. "Но мы систематически перепроверили всех ведущих кандидатов и пришли к выводу, что большинство из них, если не все, являются ложноположительными." Need говорит, что, по ее мнению, предыдущие исследования были слишком малы, чтобы должным образом оценить роль SNP.
Need работал со старшим автором Дэвидом Голдштейном из Центра вариаций генома человека и группой генетиков над сканированием генома пациентов с шизофренией и здоровых людей на предмет SNP и вариантов числа копий (CNV). Хотя ни один из ранее объявленных SNP не оказался значимым для шизофрении, несколько CNV оказались потенциально причинными.
Варианты числа копий распространены по всему геному, обычно проявляясь в виде делеций или дупликаций значительных участков ДНК. Они бывают всех размеров, но Гольдштейн говорит, что это самые большие делеции – длиной более двух миллионов оснований – которые появляются только у людей с шизофренией и могут быть уникальными и причинными у этих людей.
У пациентов с шизофренией исследователи обнаружили восемь таких делеций, две из которых были обнаружены недавно. Хотя CNV ранее были связаны с шизофренией и другими психическими заболеваниями, исследователи Duke первыми предположили, что редкость чрезвычайно больших делеций предполагает, что они действительно являются патогенными, по крайней мере, у небольшого числа пациентов.
"Это означает, что если мы собираемся добиться реального прогресса в оценке генетических связей с шизофренией, нам придется секвенировать весь геном каждого пациента с шизофренией," говорит Гольдштейн. "Это колоссальный объем работы, но только так мы сможем найти эти чрезвычайно редкие варианты."
Образец цитирования: Need AC, Ge D, Weale ME, Maia J, Feng S и др. (2009) Полногеномное исследование SNP и CNV при шизофрении. PLoS Genet 5 (2): e1000373. DOI: 10.1371 / журнал.pgen.1000373
www.плосгенетика.org / article / i … журнал.pgen.1000373
Источник: Публичная научная библиотека